不甘于生活在黑暗诅咒之下，布莱克始终与自己的命运做着抗争。这一次，他未来的道路与卡修斯紧紧联系在了一起。布莱克在SPT小队的帮助下，寻求着无尽能源。

我重生成一头马戏团的棕熊，不料全球竟开始灵气复苏

进次郎被噩梦所困扰，他梦到了曾经光之巨人奥特曼与怪兽“芝顿”对峙的梦。而且，他现在遇到了全新的问题，那就是日渐增强的奥特曼之力已经渐渐难以控制了。就在这段时间发生了假冒机动奥特曼破坏街道的事件。世界上“奥特曼危机”的舆论愈演愈烈，科特队陷入了口诛笔伐之中。只不过，这些全都是某个外星人的阴谋罢了。其中的幕后黑手居然是艾德！艾德目的只有一个，终结地球人对于奥特曼的信仰。为此，艾德引导进次郎走向成为光之巨人的道路，然后再打败进次郎。巨大化的芝顿被艾德召唤并与科特队展开了激烈的战斗。奥特六兄弟与玛丽装甲集结，并肩

2110年，地球能源已接近枯竭，环境污染日趋严重。为了实现地外星系探索计划，人类制造了名为赛尔的机器人，并建造能源探索飞船赛尔号，寻找传说中的无尽能源。

飞伦和擎锋是一对热爱爆裂飞车运动的兄弟，为了实现冠军梦，两人来到疾风都市。一次机缘巧合，他们结识了神秘的爆裂飞车-风暴猎鹰，然而没等他们搞清现状，自称黑暗战士的爆裂飞车却出现了。

天元的宇宙决战后，濒死的罗煞在千钧一发之际，被远古超文明时代爆裂帝王——猎天魄所救，来到地球。罗煞为了复仇，企图集齐6枚隐藏在遗迹里的爆裂晶片，复活猎天魄，利用其征服世界。飞伦和擎锋从天元宇宙胜利归来，后得知罗煞其意图。飞伦、擎锋与周皓博士联手，开始了阻止猎天魄复活的行动。

剧中捷德奥特曼将会与赛罗奥特曼，欧布奥特曼和伽古拉斯·伽古拉等同伴一起对战毁灭全宇宙的最邪恶兵器——巨大人工头脑吉尔巴里斯以及它的加拉德隆军团。

基因石能量渐渐恢复成基因石，且显露出更强大的力量、更多不为人知的秘密。反派势必不会轻易罢休，将以更强大的姿态卷土重来。但在艰难的挑战中，普力士等人仍看到了希望：宇宙中，分散著为数不明的「变形联盟战士」，这群代表正义的首领勇士若聚集起来，将会成为一股巨流，一起勇敢地为守护地球而战！